لماذا إزالة TFA من الببتيدات الاصطناعية ذات الصلة؟
الأغلبية الببتيدات الاصطناعية لا تزال تصنع من خلال إجراءات المرحلة الصلبة. بسبب الانقسام وخطوات التنقية القياسية ، عادة ما يحتوي المنتج الناتج على أملاح TFA. ويربط TFA الأميني termini مجانا فضلا عن سلاسل جانبية من بقايا يسين ، والحامض ، ومخلفات أرجينين. هذا الاقتران الأيوني قوي ويتطلب خطوة استبدال أيون إضافية لإزالة TFA من الببتيدات الخام أو المنقى. وهكذا ، بشكل عام ، تحتوي الببتيدات المتوفرة تجارياً على مستويات متفاوتة من TFA.
وجود TFA في المواد الببتيدية لا يتداخل فقط مع توصيف الفيزيوكيميائية ولكن يؤثر أيضا على الدراسات البيولوجية. وقد وثقت العديد من التحقيقات تأثير TFA على بنية الببتيد. على سبيل المثال ، فإن توصيف الببتيد بيتا أميلويد التخليقي أظهر التأثير القوي لإضطرابات TFA على الخواص الفيزيائية الكيميائية لهذه الببتيدات (Shen، 1994). على وجه الخصوص ، فقد تبين أن TFA يمكن أن يغير البنية الثانوية ، الذوبان ، ونزعة التجميع لبيبتيدات بيتا اميلويد الاصطناعية ، بل ويؤثر على الحجم النهائي ، والمرونة ، وهندسة ليفا بيتا اميلويد. ولذلك ، فإنه ليس من المستغرب أنه حتى كميات صغيرة من TFA يمكن أن تغير نتائج الدراسات في الجسم الحي وأن TFA الموجود على مادة peptidic يعوق توصيف العينة بواسطة التحليل الطيفي FTIR. يحتوي TFA على نطاق امتصاص قوي للأشعة تحت الحمراء (IR) عند 1673 سنتيمترًا، 1 ، متداخلًا إلى حد كبير أو حتى يحجب تمامًا الشريط الأميد 1 من الببتيد. يجب إزالة ملح TFA من الببتيد لكي يتمكن من استخدام مطيافية امتصاص الأشعة تحت الحمراء لتحديد خصائص الفيزيوكيميائية أو تحديد تركيز الببتيد. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن أن تغير TFA المربوطة الكتلة الظاهرية لببتيد كما هو محدد بالوزن. يعادل جزيء TFA واحد مرتبط ب p pتيد إضافة حمض أميني (113 دا) إلى التسلسل. لهذا السبب ، فإن المستحضرات الببتيدية ذكرت بأنها "& gt؛ 98٪ نقية (بواسطة HPLC)" غالبًا ما تحتوي على محتوى الببتيد الحقيقي بنسبة 70٪ فقط.